More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_23460  putative group 4 glycosyl transferase  100 
 
 
338 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123143  hitchhiker  0.00583742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1378  glycosyl transferase family protein  68.73 
 
 
336 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201594  hitchhiker  0.00151475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1413  glycosyl transferase family protein  67.77 
 
 
334 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0843048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3937  glycosyl transferase family protein  60.71 
 
 
380 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  64.29 
 
 
338 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1985  O-antigen initiating glycosyl transferase  61.19 
 
 
339 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1875  glycosyl transferase family protein  69.57 
 
 
338 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.939641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4053  glycosyl transferase family protein  64.26 
 
 
336 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367071  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3637  glycosyl transferase family protein  63.27 
 
 
336 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  65.33 
 
 
334 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0606  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  57.47 
 
 
338 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0913292  normal  0.206834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  49.31 
 
 
373 aa  255  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 
351 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0902  glycosyl transferase, group 4 family protein  47.17 
 
 
274 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1771  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  40.07 
 
 
321 aa  185  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  43.11 
 
 
329 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4415  glycosyl transferase family 4  42.21 
 
 
347 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1593  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  40.34 
 
 
325 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1536  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  36.01 
 
 
351 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00895  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  41.88 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  33.83 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  33.83 
 
 
334 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3657  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
337 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.402819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1872  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  41.57 
 
 
320 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2802  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0856  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 
338 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.82 
 
 
386 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2290  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
342 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.522799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.43 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2383  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1605  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  35.93 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  30.49 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0632  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
352 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0407  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 
338 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0886  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
338 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
362 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1482  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.06 
 
 
336 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3267  glycosyl transferase family 4  33.57 
 
 
326 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1110  glycosyl transferase family protein  37.67 
 
 
361 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5665  putative undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  36.3 
 
 
339 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218846  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0037  glycosyl transferase family 4  35.74 
 
 
333 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1301  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
334 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.02 
 
 
316 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2505  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
350 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  34.88 
 
 
348 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0372  family 4 glycosyl transferase  33.01 
 
 
314 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.647485  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0764  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 
338 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  32.3 
 
 
351 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.99 
 
 
380 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0775  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 
338 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.67976  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3983  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
338 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.636152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
542 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.64 
 
 
315 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  27.92 
 
 
354 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  30.47 
 
 
366 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  29.37 
 
 
406 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0249  glycosyl transferase family 4  33.7 
 
 
344 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672683  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
495 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4747  glycosyl transferase family 4  29.59 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00135226  normal  0.0198629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0336  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.85 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  28.98 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.4 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
496 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2033  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 
343 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.75 
 
 
385 aa  96.3  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  27.59 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  30.15 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0698  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  28.89 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0511  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.62 
 
 
335 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.89 
 
 
319 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.01 
 
 
441 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4162  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0513  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.62 
 
 
387 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2308  glycosyl transferase family 4  37.32 
 
 
343 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442692  normal  0.0789114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1994  glycosyl transferase family 4  38.55 
 
 
341 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.294324  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  29.43 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  28.37 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
440 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.56 
 
 
600 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3151  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.59 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1839  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.59 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3128  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.59 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1977  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.374262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3091  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.4 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0936  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2766  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>