More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0525 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  100 
 
 
406 aa  823    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  41.57 
 
 
391 aa  286  5.999999999999999e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  40.5 
 
 
351 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 
371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.18 
 
 
360 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  35.93 
 
 
354 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  38.22 
 
 
380 aa  202  7e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.93 
 
 
357 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.93 
 
 
357 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  38.53 
 
 
762 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  35.56 
 
 
312 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
351 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
351 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.38 
 
 
357 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.32 
 
 
353 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  35.71 
 
 
366 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.1 
 
 
357 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  34.67 
 
 
441 aa  195  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 
349 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 
376 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
357 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.38 
 
 
357 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.38 
 
 
357 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  35.38 
 
 
357 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
357 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  38.27 
 
 
354 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
361 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  35.47 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
521 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.7 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 
355 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  38.92 
 
 
349 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
495 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
353 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.9 
 
 
386 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
372 aa  176  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
369 aa  176  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  38.8 
 
 
385 aa  176  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  36.72 
 
 
357 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  36.53 
 
 
348 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
348 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  34.64 
 
 
340 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  38.1 
 
 
349 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.29 
 
 
329 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.79 
 
 
407 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  35.52 
 
 
367 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
542 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  32.38 
 
 
319 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.46 
 
 
416 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  34.47 
 
 
449 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.43 
 
 
403 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.06 
 
 
319 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.23 
 
 
427 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.5 
 
 
387 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2347  glycosyl transferase family 4  35.57 
 
 
370 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.6 
 
 
321 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  32.37 
 
 
330 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  35.69 
 
 
360 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  34.33 
 
 
375 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.05 
 
 
491 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  33.33 
 
 
367 aa  150  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  35.34 
 
 
389 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  33.95 
 
 
394 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  33.13 
 
 
425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  35.8 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
405 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0891  family 4 glycosyl transferase  32.84 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
336 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  33.99 
 
 
391 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  31.46 
 
 
404 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
545 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2170  glycosyl transferase family 4  32.94 
 
 
375 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.7 
 
 
551 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
369 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  32.29 
 
 
360 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  32.94 
 
 
382 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  33.22 
 
 
317 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1247  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.14 
 
 
405 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.910947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
405 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  32.46 
 
 
387 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
380 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  36.88 
 
 
364 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  36.88 
 
 
364 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2614  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.23 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2395  family 4 glycosyl transferase  31.87 
 
 
372 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1014  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
369 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.258485  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
360 aa  133  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3716  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
369 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1295  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
403 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.025134  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0580  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
375 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1064  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.87 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>