More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0344 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0344  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
305 aa  593  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  66.21 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1662  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 
305 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0516  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0493099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0121  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
307 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0123  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
307 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.299321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  28.4 
 
 
762 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  27.84 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
376 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  29.9 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  30 
 
 
351 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  27.27 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
371 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0372  family 4 glycosyl transferase  28.72 
 
 
314 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.647485  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  30.58 
 
 
394 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
349 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
495 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.94 
 
 
380 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
351 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
351 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.4 
 
 
391 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  28.97 
 
 
399 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  28.28 
 
 
351 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
380 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  29.15 
 
 
340 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  26.99 
 
 
384 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.45 
 
 
354 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
357 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  28.06 
 
 
352 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
348 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  27.76 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  26.43 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0941  glycosyl transferase family 4  30.95 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.56 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
542 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  30.03 
 
 
393 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.56 
 
 
353 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  28.12 
 
 
554 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
353 aa  95.9  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  26.38 
 
 
360 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.95 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  27.85 
 
 
406 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.87 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6508  glycosyl transferase  28.38 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.87 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  29.87 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.56 
 
 
357 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0828  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.96 
 
 
334 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
361 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.55 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4434  glycosyl transferase family 4  25.93 
 
 
351 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0799  alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  31.65 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  27.3 
 
 
357 aa  92.4  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.69 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  27.44 
 
 
360 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  29.26 
 
 
326 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.48 
 
 
600 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  27.76 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  27.76 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3144  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.77 
 
 
366 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314399  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1650  glycosyl transferase family 4  26.84 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0660163  normal  0.0551795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
496 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  25.35 
 
 
399 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.7 
 
 
357 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14141  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.84 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.03 
 
 
407 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3781  putative glycosyl transferase  28.11 
 
 
340 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0312357  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.7 
 
 
357 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1332  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25.99 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.157987  decreased coverage  0.000128778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1397  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25.99 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08601  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N- acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.05 
 
 
315 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.000144793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1295  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25.91 
 
 
359 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  28.19 
 
 
330 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.6 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
375 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
372 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2895  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  26.84 
 
 
491 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3031  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  25.42 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111205  normal  0.0113432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  28.81 
 
 
437 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0922  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13731  hypothetical protein  28.37 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0508511  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2476  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
351 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.237805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0428  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase, putative  27.8 
 
 
375 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  24.93 
 
 
360 aa  86.3  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.9 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0808  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
360 aa  86.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.326327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.37 
 
 
373 aa  86.3  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0161  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.08 
 
 
360 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710414  normal  0.664602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1804  glycosyl transferase WbpL  25.25 
 
 
334 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.145744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  25.9 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
545 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  28.83 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00705  hypothetical protein  24.84 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.61 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>