More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0881 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0881  ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000838528  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  60.81 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  56.76 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  56 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  59.21 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  57.33 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  60 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  58.11 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  60.27 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  56.76 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  51.35 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  54.79 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  49.32 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  46.84 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  52.05 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02147  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>