145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0455 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0455  GHMP family kinase  100 
 
 
401 aa  815    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0114666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  31.06 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  29.87 
 
 
387 aa  166  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  28.57 
 
 
389 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  27.81 
 
 
388 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  29.5 
 
 
397 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  27.18 
 
 
392 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  29.53 
 
 
387 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  28.72 
 
 
389 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  28.28 
 
 
385 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  28.3 
 
 
390 aa  149  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  29.22 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  29.04 
 
 
392 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  28.03 
 
 
396 aa  144  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  29 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  27.49 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  28.43 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  27.23 
 
 
387 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  25.14 
 
 
414 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  27.75 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  26.79 
 
 
394 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  27.3 
 
 
403 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  27.23 
 
 
396 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  25.63 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  25.38 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  25.96 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.38 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  25.6 
 
 
405 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  26.2 
 
 
387 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  24.81 
 
 
391 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2677  cyclic nucleotide-binding protein  24.12 
 
 
393 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  26.38 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  25.77 
 
 
394 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  27.3 
 
 
382 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  26.13 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  26.13 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  27.42 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  27.42 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  27.42 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  27.42 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  27.42 
 
 
382 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  26.85 
 
 
382 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  25.8 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  27.86 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  24.81 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  27.15 
 
 
382 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  27.39 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  27.91 
 
 
382 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  26.65 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  26.65 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  26.65 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  26.65 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  23.92 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  24.01 
 
 
383 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  25.67 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  28.02 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  26.42 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  25.65 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  24.87 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  25.65 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  25.62 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  27.41 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  26.85 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  24.64 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  26.85 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  26.85 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  26.62 
 
 
386 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  26.62 
 
 
386 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.55 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  25.33 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  25.97 
 
 
388 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  25.94 
 
 
381 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  25.46 
 
 
350 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  25.46 
 
 
350 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  25.93 
 
 
387 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  26.92 
 
 
388 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  27.14 
 
 
385 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  24.62 
 
 
388 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  23.58 
 
 
409 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  24.15 
 
 
400 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  25.26 
 
 
389 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  24.55 
 
 
379 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  26.5 
 
 
385 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  23.93 
 
 
398 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  23.65 
 
 
399 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  24.87 
 
 
351 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  24.56 
 
 
385 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  24.17 
 
 
383 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  25.44 
 
 
405 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  23.82 
 
 
392 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  23.81 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.13 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  25.13 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  27.08 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  23 
 
 
403 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  24.86 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  24.66 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  25.63 
 
 
381 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  25.45 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  25.07 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>