129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11075 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11075  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  812    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0871719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4179  hypothetical protein  31.71 
 
 
348 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4245  hypothetical protein  31.71 
 
 
348 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203557  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4401  hypothetical protein  31.71 
 
 
348 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4699  hypothetical protein  31.38 
 
 
363 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2024  hypothetical protein  32.01 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal  0.325571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.29 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.51 
 
 
1667 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  29.13 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  30.1 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.91 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.07 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.18 
 
 
1094 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  32.84 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.06 
 
 
689 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.43 
 
 
479 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  28.24 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.92 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  28.74 
 
 
819 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  30.04 
 
 
971 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  28.22 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.78 
 
 
810 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.87 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.65 
 
 
752 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.94 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.6 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  31.75 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 
776 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.21 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.12 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 
317 aa  63.5  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.53 
 
 
272 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.75 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  26.58 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.99 
 
 
334 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.33 
 
 
457 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  26.86 
 
 
556 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.13 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.9 
 
 
347 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.22 
 
 
417 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.01 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.75 
 
 
607 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.61 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.27 
 
 
394 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.89 
 
 
328 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
324 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.3 
 
 
479 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  24.17 
 
 
334 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.81 
 
 
327 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  26.26 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.57 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.49 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1457  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.97 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.803154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.32 
 
 
192 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.5 
 
 
323 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 
329 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.79 
 
 
366 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.41 
 
 
362 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3498  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.63 
 
 
540 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.08 
 
 
362 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.63 
 
 
366 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.81 
 
 
943 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.21 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  28.15 
 
 
325 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.52 
 
 
821 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  28.66 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  28.66 
 
 
330 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.63 
 
 
332 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5257  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.47 
 
 
478 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.73 
 
 
320 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.09 
 
 
1056 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.25 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  33.55 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.86 
 
 
974 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.99 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.29 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.14 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.3 
 
 
492 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.73 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.83 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.3 
 
 
314 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.24 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  26.4 
 
 
312 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.25 
 
 
334 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.15 
 
 
488 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.65 
 
 
327 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.43 
 
 
1067 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.58 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.67 
 
 
336 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  27.06 
 
 
329 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.58 
 
 
357 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.7 
 
 
311 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 
336 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3857  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.52 
 
 
491 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.337785  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0105  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  47.14 
 
 
140 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4934  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.52 
 
 
491 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.09 
 
 
314 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>