More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10862 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10862  two component sensor kinase  100 
 
 
425 aa  839    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.889894  hitchhiker  0.000152401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0486  putative signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
408 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
398 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
398 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
519 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  31.98 
 
 
525 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  31.38 
 
 
350 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.51 
 
 
391 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
780 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.03 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  32.05 
 
 
1739 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
780 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  28.75 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  29.49 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
594 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.63 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
658 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  29.49 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
595 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
598 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  31.19 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  29.03 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  32.39 
 
 
740 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
989 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
480 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
480 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  29.49 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  29.49 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  29.49 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.37 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.9 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.68 
 
 
640 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  27.59 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  27.23 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
1046 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  26.29 
 
 
772 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  29.5 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  29.5 
 
 
351 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  31.17 
 
 
575 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.65 
 
 
395 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  31.17 
 
 
575 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
662 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  25.82 
 
 
270 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.63 
 
 
662 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
703 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  29.56 
 
 
657 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.74 
 
 
575 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  29.3 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  29.13 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  34.4 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  29.03 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  28.43 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  26.13 
 
 
668 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
748 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
700 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
700 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
610 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  33.11 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  28.93 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  25 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.8 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
725 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  33.81 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  26.34 
 
 
772 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.19 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  29.77 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  28.76 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  28.5 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  28.5 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  28.5 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
700 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
596 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  28.5 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  28.5 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.13 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.81 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
684 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>