More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1823 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1823  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
94 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00689544  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3038  heat shock protein DnaJ-like protein  80.65 
 
 
94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.928847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1868  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  80.65 
 
 
94 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0272604  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1832  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  80.65 
 
 
94 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.244123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  80.65 
 
 
94 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0852729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1631  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  80.65 
 
 
94 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.261278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2457  heat shock protein DnaJ domain protein  80.65 
 
 
94 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000320738  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1850  DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 
94 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1539  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 
94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1606  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 
94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00300072  normal  0.339336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1600  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 
94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.537341  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0750  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  76.6 
 
 
94 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  39.13 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
377 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
374 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  41.79 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 
382 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  40.3 
 
 
375 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
377 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
375 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
372 aa  63.5  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
381 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
373 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
373 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  35.82 
 
 
376 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
380 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
382 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
379 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
382 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
378 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
382 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1616  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
352 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  35.82 
 
 
384 aa  61.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  38.81 
 
 
645 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
377 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  46.67 
 
 
400 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  34.33 
 
 
381 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  34.33 
 
 
369 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  35.82 
 
 
383 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
381 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  46.67 
 
 
382 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
377 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
377 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
378 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
376 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  34.33 
 
 
369 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0258  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.57 
 
 
451 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
377 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  46.67 
 
 
401 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
378 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  47.46 
 
 
394 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
378 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
377 aa  60.5  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
378 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
385 aa  60.5  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
377 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
379 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  43.28 
 
 
297 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
386 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  36.23 
 
 
375 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44959  predicted protein  40.3 
 
 
500 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00935633  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
370 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
378 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
380 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  43.28 
 
 
297 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
370 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  38.03 
 
 
299 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  38.81 
 
 
381 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>