More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1539 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1539  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
94 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1606  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
94 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00300072  normal  0.339336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1600  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
94 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.537341  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1850  DnaJ domain-containing protein  98.94 
 
 
94 aa  193  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1868  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.36 
 
 
94 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0272604  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2457  heat shock protein DnaJ domain protein  89.36 
 
 
94 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000320738  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1631  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.36 
 
 
94 aa  176  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.261278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1832  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.36 
 
 
94 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.244123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  89.36 
 
 
94 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0852729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3038  heat shock protein DnaJ-like protein  82.98 
 
 
94 aa  167  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.928847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1823  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 
94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00689544  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0750  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  81.72 
 
 
94 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  43.48 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  41.79 
 
 
645 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 
377 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  43.28 
 
 
377 aa  67  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44959  predicted protein  49.28 
 
 
500 aa  67  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00935633  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  46.15 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  33.67 
 
 
375 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  42.03 
 
 
381 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
383 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 
386 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  42.17 
 
 
380 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  42.03 
 
 
356 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  44.93 
 
 
375 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
382 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
374 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 
366 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  43.48 
 
 
375 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
381 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
356 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
374 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  40.58 
 
 
374 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  40.85 
 
 
375 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
374 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
378 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  38.81 
 
 
376 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
375 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  41.79 
 
 
330 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
374 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  38.81 
 
 
376 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  38.57 
 
 
374 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  40.58 
 
 
359 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3228  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.862412  normal  0.903575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
385 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  37.68 
 
 
377 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
368 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
383 aa  60.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
376 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9321  predicted protein  43.28 
 
 
71 aa  60.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  41.79 
 
 
381 aa  60.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
373 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0258  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
451 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  44.78 
 
 
297 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  44.12 
 
 
279 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
377 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
376 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  40.24 
 
 
385 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  46.38 
 
 
301 aa  60.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  44.78 
 
 
297 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
380 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.3 
 
 
302 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
379 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 
370 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
378 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  41.43 
 
 
367 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
376 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2086  DnaJ domain-containing protein  45.45 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000110327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
375 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
377 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
376 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
375 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 
380 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3323  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.65 
 
 
643 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429446  normal  0.119258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
376 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
377 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>