More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1850 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1850  DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1539  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  98.94 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1606  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  98.94 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00300072  normal  0.339336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1600  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  98.94 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.537341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2457  heat shock protein DnaJ domain protein  90.43 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000320738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1868  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  90.43 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0272604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1832  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  90.43 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.244123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  90.43 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0852729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1631  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  90.43 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.261278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3038  heat shock protein DnaJ-like protein  82.98 
 
 		 94 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.928847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1823  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  79.57 
 
 		 94 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00689544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0750  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  81.72 
 
 		 94 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  43.48 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 377 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  41.79 
 
 		 645 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  43.28 
 
 		 377 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44959  predicted protein  49.28 
 
 		 500 aa  67  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00935633  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  46.15 
 
 		 377 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 383 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  42.03 
 
 		 381 aa  64.7  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  41.79 
 
 		 375 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  47.69 
 
 		 386 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  42.17 
 
 		 380 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  42.03 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  44.93 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 381 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  43.48 
 
 		 375 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  38.81 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  38.81 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 		 375 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  40.58 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  37.68 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  40.58 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  41.79 
 
 		 330 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  38.57 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3228  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.862412  normal  0.903575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  40.85 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 373 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  41.79 
 
 		 381 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 385 aa  60.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  40.24 
 
 		 385 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 377 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 383 aa  60.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.3 
 
 		 302 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  44.12 
 
 		 279 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9321  predicted protein  43.28 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3333  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 		 381 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 379 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 380 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  38.89 
 
 		 358 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  39.13 
 
 		 370 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  44.78 
 
 		 297 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  37.8 
 
 		 379 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  38.1 
 
 		 380 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 375 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  44.78 
 
 		 297 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 		 376 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 375 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 		 379 aa  60.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>