49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2794 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2794  opacity protein and related surface antigens-like protein  100 
 
 		 188 aa  373  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  40.34 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.5 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0702  hypothetical protein  31.54 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.574194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  30.88 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  30.77 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  36.09 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  34.53 
 
 		 566 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  30.51 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.46 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  28.93 
 
 		 254 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.61 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  34.59 
 
 		 578 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  27.5 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  33.09 
 
 		 570 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  27.32 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  32.3 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.65 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  32.91 
 
 		 559 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  33.82 
 
 		 550 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  31.61 
 
 		 209 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  29.38 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  27.67 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  31.25 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  32.5 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  29.27 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  32.91 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  33.82 
 
 		 570 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  34.59 
 
 		 562 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  30.53 
 
 		 452 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  28.57 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  30.77 
 
 		 453 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  31.65 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  32.54 
 
 		 997 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  26.06 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32.33 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  34.31 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  27.78 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  36.59 
 
 		 449 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  32 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  32.1 
 
 		 243 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  27.94 
 
 		 237 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  42  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.58 
 
 		 262 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  30.47 
 
 		 240 aa  42  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  42  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  28.83 
 
 		 229 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  32.58 
 
 		 561 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  28.08 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>