More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1572 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 307 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  39.07 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  34.21 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  38.03 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  37.62 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  37.62 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  37.62 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  37.62 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  37.62 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  37.62 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  37.62 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  37.62 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  35.1 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  37.75 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  37.29 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  34.77 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04490  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.52 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.184188  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  37 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  36.42 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  36.42 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.31 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.31 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.31 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  34.31 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.31 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.64 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.93 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  33.99 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.99 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.99 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  33.99 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  33.99 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  33.99 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  37.62 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  35.06 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  31.95 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  32.25 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  32.25 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  32.25 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  32.25 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  33.73 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  32.12 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  32.34 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  n/a   
 
 
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  31.95 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  31.95 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>