193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0272 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0272  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1098    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0949  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.8 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  25.11 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  25.89 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  25.89 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  25.45 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  24.81 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2703  uracil-DNA glycosylase  27.34 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  29.07 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  24.9 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2017  Uracil DNA glycosylase-like protein  24.03 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  25.58 
 
 		 225 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  24.21 
 
 		 230 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  28.78 
 
 		 233 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  24.9 
 
 		 225 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  23.02 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  27.78 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  26.36 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  23.72 
 
 		 225 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  24.11 
 
 		 225 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  24.56 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  27.56 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  25.68 
 
 		 222 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  24.11 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  24.44 
 
 		 232 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  29.13 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  24.27 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  28.68 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  28.68 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  27.31 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  23.02 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  23.02 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  23.85 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  23.41 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  24.81 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  24.7 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  24.81 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  23.73 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1665  hypothetical protein  31.43 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2594  Uracil-DNA glycosylase  27.27 
 
 		 233 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.744963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  25.21 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  27.31 
 
 		 229 aa  60.1  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0239  uracil-DNA glycosylase  27.11 
 
 		 219 aa  59.7  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.322899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  25.11 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  25.33 
 
 		 241 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  25.79 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  29.13 
 
 		 253 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1659  hypothetical protein  31.62 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  24.51 
 
 		 226 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26.59 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  24.11 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  28.3 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  27.55 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  25.21 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  26.92 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  26.32 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  27.23 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  27.17 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  26.58 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  25.66 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  26.09 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  26.88 
 
 		 255 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  26.79 
 
 		 304 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  23.79 
 
 		 222 aa  57  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0733  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.48 
 
 		 229 aa  57  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  24 
 
 		 230 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  23.11 
 
 		 230 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  26.32 
 
 		 229 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  30.95 
 
 		 227 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  25.66 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  24.02 
 
 		 231 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  25.66 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  24.55 
 
 		 240 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  25.66 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  24.89 
 
 		 229 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  24.89 
 
 		 229 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  25.56 
 
 		 218 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  24.89 
 
 		 229 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1473  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.22 
 
 		 234 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.422171  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  24.89 
 
 		 229 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  25.54 
 
 		 229 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  25.56 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  27.35 
 
 		 221 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  25.54 
 
 		 229 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  25.54 
 
 		 229 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  25.54 
 
 		 229 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  27.06 
 
 		 225 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  24.89 
 
 		 229 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  24.89 
 
 		 229 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  24.45 
 
 		 231 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  25.11 
 
 		 222 aa  55.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  23.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  25.56 
 
 		 219 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  24.66 
 
 		 225 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  27.17 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  26.64 
 
 		 222 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  24.89 
 
 		 222 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  25.44 
 
 		 226 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>