60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1659 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1659  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  494  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1665  hypothetical protein  98.33 
 
 
239 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0272  hypothetical protein  31.62 
 
 
537 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0949  Uracil-DNA glycosylase superfamily  24.19 
 
 
537 aa  58.5  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2017  Uracil DNA glycosylase-like protein  30.18 
 
 
551 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490669  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  27.36 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0239  uracil-DNA glycosylase  29.95 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.322899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  26.79 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  27.03 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  24.66 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  27.03 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  25.11 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  27.03 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  26.32 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  23.58 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  24.66 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  25.76 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  26.01 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  23.36 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  27.19 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  26.82 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  24.24 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  24.24 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  25.46 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  24.64 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  24.88 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  23.21 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  25.68 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  24.77 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  25.68 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  23.59 
 
 
217 aa  45.8  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  27.66 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  27.95 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  25.11 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  26.54 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  23.32 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  25.51 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  23.32 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  25.13 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  25.71 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  24.77 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  25.26 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  25.14 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  23.89 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  26.54 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  26.7 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  26.36 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  26.71 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  26.94 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  23.96 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  24.77 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0138  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.18 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  24.73 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  25.14 
 
 
225 aa  42  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  25.35 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  25.34 
 
 
233 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  25.11 
 
 
230 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  25.49 
 
 
229 aa  42  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  24.1 
 
 
329 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.1698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>