75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1164 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  79.65 
 
 		 173 aa  287  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  79.65 
 
 		 173 aa  287  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  79.07 
 
 		 173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  77.91 
 
 		 173 aa  283  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  77.33 
 
 		 173 aa  276  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  78.36 
 
 		 178 aa  275  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  77.78 
 
 		 178 aa  273  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  76.57 
 
 		 175 aa  248  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  66.48 
 
 		 181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  65.34 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  61.85 
 
 		 175 aa  231  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  63.37 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  62.79 
 
 		 174 aa  228  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  63.95 
 
 		 180 aa  221  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  63.84 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  41.72 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  42.33 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  39.26 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  39.77 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  41.21 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  39.75 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  39.75 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  39.75 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  40.72 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  39.13 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  39.75 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  37.04 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  39.18 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  37.74 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  38.04 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  36.16 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  39.62 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  36.16 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  40.49 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  41.1 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  38.51 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  37.27 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  41.1 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  37.79 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  36.09 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  36.02 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  36.78 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  38.04 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  37.42 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  40.12 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0023  hypothetical protein  37.42 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  35.5 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  35.5 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  35.5 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  35.5 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  35.5 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  35.5 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0024  hypothetical protein  36.81 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  34.18 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  35.16 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  32.69 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  32.87 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  34.46 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  29.89 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  26.62 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  33.33 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  34.46 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  31.11 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  32.17 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0568  hypothetical membrane spanning protein  31.25 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360077  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  31.5 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6144  hypothetical protein  32.12 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0276801  normal  0.0599178 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1593  hypothetical protein  31.25 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  26.32 
 
 		 104 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  24.26 
 
 		 105 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>