71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2741 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  352  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  49.09 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  47.27 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  51.57 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  51.57 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  48.17 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  52.2 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  42.42 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  47.56 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  43.68 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  48.5 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  45.88 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  47.31 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  50.31 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  47.02 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  42.94 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  45.61 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  50.61 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  46.51 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  50.94 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  46.75 
 
 		 171 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  47.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  50.94 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  45.66 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  48.75 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  47.65 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  43.9 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  42.33 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  42.33 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  40.44 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  43.71 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  35.06 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  35.06 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  35.06 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  34.42 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  34.18 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  34.42 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  31.71 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  37.13 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  34.42 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  31.87 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  33.77 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  34.36 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  30.86 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  34.73 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  30.63 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  32.47 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  30.18 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  33.59 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  35.14 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  32.89 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  30.32 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  30.92 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0024  hypothetical protein  27.63 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  31.21 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  30.37 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0023  hypothetical protein  27.63 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  28.5 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  27.59 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  26.24 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  25.83 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  29.25 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6144  hypothetical protein  29.45 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0276801  normal  0.0599178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  40.74 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  25.44 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>