76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2540 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  97.13 
 
 
174 aa  330  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  90.8 
 
 
174 aa  313  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  89.66 
 
 
174 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  92.53 
 
 
174 aa  291  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  83.91 
 
 
174 aa  241  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  70.76 
 
 
175 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  71.08 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  64.46 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  62.65 
 
 
174 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  67.47 
 
 
170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  63.19 
 
 
177 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  63.19 
 
 
177 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  67.47 
 
 
182 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  65.06 
 
 
174 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  60.24 
 
 
174 aa  200  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  65.66 
 
 
174 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  72.09 
 
 
175 aa  196  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  72.09 
 
 
175 aa  196  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  72.09 
 
 
175 aa  196  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  72.09 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  72.09 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  72.09 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  64.33 
 
 
165 aa  195  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  62.28 
 
 
178 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  66.87 
 
 
174 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  66.27 
 
 
170 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  54.65 
 
 
172 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  57.67 
 
 
165 aa  184  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  60.62 
 
 
189 aa  184  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  53.37 
 
 
179 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  52.84 
 
 
181 aa  168  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  52.91 
 
 
179 aa  167  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  55 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  51.57 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  37.7 
 
 
183 aa  120  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  34.1 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  39.18 
 
 
173 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  39.75 
 
 
174 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  36.46 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  37.11 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  34.78 
 
 
180 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  36.48 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  36.09 
 
 
173 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  36.97 
 
 
175 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  34.91 
 
 
174 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  35.93 
 
 
177 aa  101  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  37.71 
 
 
175 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  32.53 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0023  hypothetical protein  29.63 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0024  hypothetical protein  29.63 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  34.12 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  34.46 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  36.43 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  35.38 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  33.57 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  35.76 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  33.56 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  29.61 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  34.25 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  33.1 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  29.79 
 
 
214 aa  62.8  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  30.92 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  28.75 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01522  DUF962 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05310)  32.68 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0568  hypothetical membrane spanning protein  30.82 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1593  hypothetical protein  30.82 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  26.81 
 
 
105 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6144  hypothetical protein  31.4 
 
 
183 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0276801  normal  0.0599178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  26.47 
 
 
104 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>