72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0024 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0024  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0023  hypothetical protein  98.82 
 
 
182 aa  321  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  35.62 
 
 
178 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  34.44 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  36.65 
 
 
173 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  30.68 
 
 
174 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  35.56 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  32.5 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  33.15 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  36.02 
 
 
173 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  31.79 
 
 
165 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  92  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  33.16 
 
 
183 aa  90.9  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  33.75 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  35.4 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  35.4 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  32.4 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  37.13 
 
 
180 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  29.63 
 
 
174 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  29.63 
 
 
174 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  33.12 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  29.63 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  34.15 
 
 
177 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  35 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  35 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  32.73 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  31.9 
 
 
170 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  33.54 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  30.63 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  32.5 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  32.5 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  28.9 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  34.34 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  29.76 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  32.73 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  29.76 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  29.57 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  31.9 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  32.3 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  30.73 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  33.12 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  32.73 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  35.06 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0568  hypothetical membrane spanning protein  31.58 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1593  hypothetical protein  31.58 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  29.61 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  31.87 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  31.87 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  29.28 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  31.87 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  32.5 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  28.49 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  30.06 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  30.06 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  30.06 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  61.6  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  30.26 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  35.21 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  34.15 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  28.66 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  25.34 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  31.58 
 
 
145 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  29.45 
 
 
144 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  27.59 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  26.9 
 
 
154 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  29.93 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  28.78 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01522  DUF962 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05310)  34.72 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  23.74 
 
 
214 aa  40.8  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>