76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2924 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  83.82 
 
 		 177 aa  308  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  69.19 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  66.86 
 
 		 173 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  67.05 
 
 		 178 aa  234  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  66.47 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  66.29 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  64.53 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  64.53 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  65.12 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  64.53 
 
 		 173 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  64.16 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  68.24 
 
 		 175 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  62.79 
 
 		 174 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  64.97 
 
 		 177 aa  220  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  63.48 
 
 		 181 aa  220  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  52.2 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  40.12 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  37.65 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  34.3 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  38.51 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  36.31 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  38.51 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  36.26 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  36.42 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  38.65 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  37.42 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  38.96 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  36.2 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  39.08 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  34.91 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  34.91 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  35.85 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  35.26 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  36 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  36 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  35.91 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  36.71 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  35.67 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  33.73 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  36.75 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  36.99 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  35.2 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  35.8 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  34.29 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  34.19 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  34.19 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  34.19 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  34.84 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  34.84 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  34.84 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  35 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0023  hypothetical protein  35.62 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0024  hypothetical protein  35 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  33.57 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  33.79 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  35.82 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  31.94 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  29.22 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  29.61 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  30.72 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  32.12 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  30.14 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  31.78 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6144  hypothetical protein  28.22 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0276801  normal  0.0599178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0568  hypothetical membrane spanning protein  28.93 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  26.32 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  29.28 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  28.47 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  29.85 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1593  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455511  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01522  DUF962 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05310)  34.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  21.48 
 
 		 105 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>