75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4743 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  79.75 
 
 		 165 aa  266  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  65.45 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  65.45 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  58.75 
 
 		 174 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  59.15 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  64.33 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  64.33 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  64.33 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  63.06 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  59.15 
 
 		 170 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  60.98 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  63.69 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  56.1 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  60.98 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  60.37 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  64.97 
 
 		 175 aa  183  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  63.69 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  60.25 
 
 		 174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  55.76 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  52.5 
 
 		 172 aa  176  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  56.71 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  55.28 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  56.25 
 
 		 189 aa  170  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  57.93 
 
 		 174 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  56.71 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  53.05 
 
 		 179 aa  163  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  64.38 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  64.38 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  64.38 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  64.38 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  64.38 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  64.38 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  53.66 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  56.71 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  45.73 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  47.1 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  41.29 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  40.91 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  43.51 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  40.26 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  40.37 
 
 		 183 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  42.21 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  42.21 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  37.04 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  37.2 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  40.23 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  36.81 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  36.75 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  35.76 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  36.65 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  36.71 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0023  hypothetical protein  32.14 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0024  hypothetical protein  32.14 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  36.73 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  38.36 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  36.92 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  31.79 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  35.46 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  30.97 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  31.79 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  33.33 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  34.01 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0568  hypothetical membrane spanning protein  31.41 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  30.34 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  27.91 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1593  hypothetical protein  31.41 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  31.11 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  27.54 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01522  DUF962 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05310)  51.85 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  27.01 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  27.65 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>