76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4046 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  79.75 
 
 		 165 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  65.03 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  65.03 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  55.83 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  57.06 
 
 		 174 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  57.67 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  57.67 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  57.67 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  56.44 
 
 		 174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  58.75 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  58.9 
 
 		 178 aa  180  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  60.37 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  56.44 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  52.15 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  58.28 
 
 		 174 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  56.44 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  57.67 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  60.87 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  54.88 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  58.13 
 
 		 174 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  58.02 
 
 		 174 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  53.94 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  55.62 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  57.06 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  52.73 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  57.58 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  57.58 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  57.58 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  57.58 
 
 		 175 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  57.58 
 
 		 175 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  57.58 
 
 		 175 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  54.6 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  42.51 
 
 		 171 aa  150  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  51.5 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  40.12 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  42.31 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  41.67 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  42.95 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  40.26 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  47.65 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  39.26 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  46.25 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  45.62 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  45.62 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  46.79 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  38.75 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  38.75 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  43.51 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  37.42 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  34.76 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  37.74 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  35.58 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  35.44 
 
 		 154 aa  84  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  36.91 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  35.26 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0023  hypothetical protein  32.52 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  38.3 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0024  hypothetical protein  32.52 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  37.5 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  34.46 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  35.38 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  31.79 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  34.93 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  34.25 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  28.99 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  27.54 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  27.74 
 
 		 104 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0568  hypothetical membrane spanning protein  28.76 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1593  hypothetical protein  28.76 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455511  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  30.18 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01522  DUF962 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05310)  43.55 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6144  hypothetical protein  29.52 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0276801  normal  0.0599178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>