66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3830 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  213  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  44.33 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  27.74 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  26.32 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  26.32 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  26.32 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  39.68 
 
 		 183 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  35.44 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  27.74 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  40.98 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  56.41 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  23.29 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  22.46 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  28.36 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  39.34 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  24.63 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  21.74 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  38.37 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  26.47 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  29.1 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  55.88 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  28.03 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  27.01 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  55.88 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  24.18 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  43.48 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  28.15 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  28.15 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  39.58 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  45.45 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  24.64 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  45.65 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  34.67 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  27.41 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  34.67 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  26.06 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  27.94 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  51.43 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  36.96 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  58.06 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  58.06 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  27.21 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  47.62 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  43.18 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  54.84 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  47.62 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  47.62 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  28.68 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  51.43 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  51.43 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  26.47 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  51.43 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  26.47 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  26.47 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  41.86 
 
 		 161 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.876463  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  26.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  38.78 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  27.54 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>