70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2031 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2031  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  219  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  44.33 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1273  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  28.78 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4341  hypothetical protein  25.76 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00916833  normal  0.0810191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  28.79 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  28.68 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4046  hypothetical protein  27.54 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4743  hypothetical protein  27.54 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0590545  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1382  hypothetical protein  26.52 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.423125  normal  0.571464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4352  hypothetical protein  28.03 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2588  hypothetical protein  26.09 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2540  hypothetical protein  26.81 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000584092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2564  hypothetical protein  27.54 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125447  normal  0.0293581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0242  hypothetical protein  26.52 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  25.76 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1928  hypothetical protein  26.81 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03590  hypothetical protein  27.61 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00673142  hitchhiker  0.0000000000985547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  27.61 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2458  hypothetical protein  27.54 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0748  hypothetical protein  28.26 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3728  protein of unknown function DUF962  27.14 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1155  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1433  hypothetical protein  41.51 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.331828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01916  putative PRS2 protein  50 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0781944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2387  hypothetical protein  35.44 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2761  hypothetical protein  24.44 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300916  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  42.22 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0562  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871641  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  42.22 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2142  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2265  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01901  hypothetical protein  42.22 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal  0.226863 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0935  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0939  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  41.07 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1090  PRS2-like protein  50 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02202  hypothetical protein  27.66 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003642  putative PRS2 protein  27.96 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2804  hypothetical protein  41.79 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.876463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1022  hypothetical protein  39.22 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1045  hypothetical protein  22.86 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1164  hypothetical protein  24.26 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.111919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5871  hypothetical protein  45.65 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111147  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5285  hypothetical protein  39.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0193871  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  24.65 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2842  hypothetical protein  24.26 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.385043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0885  hypothetical protein  24.46 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4828  hypothetical protein  38.64 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2216  hypothetical protein  46 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.75195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2925  hypothetical protein  24.68 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4432  hypothetical protein  51.61 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0824992  normal  0.0162853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  22.14 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1283  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0537198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2060  hypothetical protein  45.24 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3107  protein of unknown function DUF962  25 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  0.0193379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2924  hypothetical protein  21.48 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0756  hypothetical protein  46.34 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.150985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1250  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000939953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1353  hypothetical protein  34.43 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04207  hypothetical protein  22.14 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1206  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013075  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7044  protein of unknown function DUF962  26.09 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.99733  normal  0.010164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2741  hypothetical protein  28.03 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3021  hypothetical protein  24.26 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0267108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1059  hypothetical protein  29.03 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  26.67 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0829  protein of unknown function DUF962  44.44 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.913113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1822  hypothetical protein  41.03 
 
 		 154 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>