131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0498 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0498  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 133 aa  272  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0571  putative thioesterase protein  48.09 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0612  putative thioesterase protein  48.44 
 
 		 133 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618315  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1002  hypothetical protein  41.94 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  29.31 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.4 
 
 		 285 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 292 aa  50.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  28.57 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 286 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.6 
 
 		 289 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 		 289 aa  47.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  35.04 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.59 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 		 287 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  26.67 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 287 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  24.59 
 
 		 288 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  28.95 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.72 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.1 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.72 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.43 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  25.4 
 
 		 287 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  29.91 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  26.05 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  26.27 
 
 		 161 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  26.05 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  26.05 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  26.05 
 
 		 164 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  25.77 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>