More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1546 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1546  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 441 aa  857    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0773917  normal  0.939305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  90.16 
 
 		 311 aa  555  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.59 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  61.9 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.87 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.15 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.27 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.21 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.31 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.82 
 
 		 514 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.6 
 
 		 452 aa  352  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.83 
 
 		 373 aa  350  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.43 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.07 
 
 		 347 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  59.81 
 
 		 451 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.8 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  60.66 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.85 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.77 
 
 		 501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  64.02 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  60.54 
 
 		 671 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.06 
 
 		 329 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.91 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  54.21 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.5 
 
 		 515 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.12 
 
 		 482 aa  332  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  50.83 
 
 		 495 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.56 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.48 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.49 
 
 		 397 aa  329  7e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.61 
 
 		 611 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.14 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.61 
 
 		 621 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.61 
 
 		 615 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.61 
 
 		 540 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  54.9 
 
 		 563 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.06 
 
 		 389 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.17 
 
 		 491 aa  322  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.47 
 
 		 477 aa  322  7e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.64 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.94 
 
 		 562 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  57.64 
 
 		 510 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.94 
 
 		 391 aa  318  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.56 
 
 		 487 aa  318  9e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.25 
 
 		 643 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.94 
 
 		 582 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  55 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.9 
 
 		 540 aa  317  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  55 
 
 		 541 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  55 
 
 		 523 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.13 
 
 		 354 aa  315  7e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  52.46 
 
 		 541 aa  315  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.86 
 
 		 375 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2305  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.61 
 
 		 315 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.44 
 
 		 561 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.9 
 
 		 587 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  54.09 
 
 		 491 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.93 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.01 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  54.61 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  54.93 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  54.61 
 
 		 497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  54.61 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  54.61 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  54.93 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  54.61 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  54.61 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  54.61 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  54.93 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.52 
 
 		 387 aa  309  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  54.61 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  53.95 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.55 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.63 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  54.18 
 
 		 408 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.79 
 
 		 342 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  54.28 
 
 		 491 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.4 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  56.11 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  56.11 
 
 		 355 aa  302  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  54.36 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.67 
 
 		 382 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.37 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  50.15 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2753  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.62 
 
 		 316 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.62 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  54.18 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  50.98 
 
 		 324 aa  296  6e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.29 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.93 
 
 		 433 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  50.98 
 
 		 350 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.04 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  52 
 
 		 476 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  52 
 
 		 476 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 376 aa  292  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 326 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.67 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.67 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>