More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25780  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  100 
 
 
177 aa  366  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1729  2-nitropropane dioxygenase NPD  60 
 
 
326 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.26 
 
 
326 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.78 
 
 
326 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03920  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  47.01 
 
 
316 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  0.810492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04180  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  47.01 
 
 
316 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.92 
 
 
316 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 
309 aa  89  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.03 
 
 
357 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.51 
 
 
363 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.36 
 
 
313 aa  84.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.72 
 
 
315 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.41 
 
 
360 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  37.72 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.75 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  38.73 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  41.35 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  39.32 
 
 
370 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.46 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.12 
 
 
335 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  36.71 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.41 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.25 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.76 
 
 
358 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.26 
 
 
319 aa  75.1  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.97 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.71 
 
 
359 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.13 
 
 
355 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.13 
 
 
355 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.76 
 
 
361 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.33 
 
 
318 aa  74.7  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  37.58 
 
 
321 aa  74.7  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.54 
 
 
374 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.54 
 
 
374 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  40 
 
 
321 aa  74.3  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.16 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.25 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.91 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  41.04 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.69 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.9 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.9 
 
 
324 aa  70.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.04 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.71 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.56 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.97 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.71 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  49.43 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.67 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.04 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.84 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  42.86 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.18 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.05 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.26 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.69 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  38.69 
 
 
383 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.19 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.67 
 
 
319 aa  68.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.71 
 
 
380 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.81 
 
 
312 aa  68.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40 
 
 
365 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  44.79 
 
 
333 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.14 
 
 
363 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.05 
 
 
311 aa  67.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.19 
 
 
332 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.43 
 
 
353 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.14 
 
 
378 aa  67.4  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.16 
 
 
349 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.16 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.59 
 
 
323 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  33.1 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.29 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.4 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.84 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.67 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.71 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.52 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  30.82 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.49 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.65 
 
 
376 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.1 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.1 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.86 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.61 
 
 
329 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  32.72 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.78 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.44 
 
 
353 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.18 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.65 
 
 
378 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.19 
 
 
378 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  30.19 
 
 
363 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.67 
 
 
324 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  33.79 
 
 
351 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  33.79 
 
 
351 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.51 
 
 
305 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.62 
 
 
342 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>