More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03920  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  100 
 
 
316 aa  629  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  0.810492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04180  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  94.94 
 
 
316 aa  557  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.76 
 
 
326 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.76 
 
 
326 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1729  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.45 
 
 
326 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.8 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  35.02 
 
 
317 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.22 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  32.92 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  32.82 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.23 
 
 
319 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.02 
 
 
319 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.03 
 
 
315 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.85 
 
 
338 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.25 
 
 
363 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.23 
 
 
314 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.23 
 
 
314 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.48 
 
 
328 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.94 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.96 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.4 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.09 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  35.13 
 
 
363 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.37 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.53 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.12 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.2 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  35.13 
 
 
363 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.7 
 
 
331 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.6 
 
 
323 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.3 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.08 
 
 
329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.48 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  34.05 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  33.69 
 
 
364 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.33 
 
 
331 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  34.05 
 
 
364 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.94 
 
 
323 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.11 
 
 
316 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.32 
 
 
331 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  33.69 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.47 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  33.69 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.94 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.56 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.97 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.66 
 
 
332 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.43 
 
 
342 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.22 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 
364 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 
364 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.06 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.34 
 
 
325 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.71 
 
 
325 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.5 
 
 
324 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.88 
 
 
331 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.38 
 
 
324 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.18 
 
 
323 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.1 
 
 
305 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  29.96 
 
 
347 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28.75 
 
 
324 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.71 
 
 
351 aa  106  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.51 
 
 
355 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.72 
 
 
311 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.56 
 
 
305 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  28.48 
 
 
318 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25780  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  39.61 
 
 
177 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.28 
 
 
324 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.09 
 
 
334 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.25 
 
 
325 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  31.36 
 
 
351 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.19 
 
 
321 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.35 
 
 
380 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.32 
 
 
313 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.97 
 
 
324 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  29.64 
 
 
314 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  31.36 
 
 
351 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.94 
 
 
353 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.84 
 
 
312 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.91 
 
 
345 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.45 
 
 
338 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.78 
 
 
335 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.54 
 
 
356 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.54 
 
 
356 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.54 
 
 
356 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  30.13 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.86 
 
 
352 aa  99.4  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  31.82 
 
 
361 aa  99.4  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.66 
 
 
351 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.62 
 
 
386 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.71 
 
 
322 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.66 
 
 
324 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.47 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.74 
 
 
356 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.44 
 
 
329 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  30.93 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.03 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.87 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.87 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>