39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2751 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2751  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 446 aa  914    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.202947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  33.43 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3661  Carbohydrate-selective porin OprB  30.96 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3768  Carbohydrate-selective porin OprB  31.68 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  29.28 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1112  hypothetical protein  27.43 
 
 		 490 aa  90.5  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.503741  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1085  Carbohydrate-selective porin OprB  23.36 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000116954  decreased coverage  8.02155e-19 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2127  Carbohydrate-selective porin OprB  27.6 
 
 		 494 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.96067  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  25.48 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  25.49 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  25.48 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  25.25 
 
 		 680 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  25.4 
 
 		 724 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3629  carbohydrate-selective porin OprB  30.57 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419401  decreased coverage  0.00176786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  26.63 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0352  carbohydrate-selective porin OprB  23.99 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  25.63 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  22.26 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  23.81 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  23.81 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  25.37 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  24.39 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  23.81 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  24.04 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  24.04 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  29.63 
 
 		 624 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  24.04 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  24.04 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  30.94 
 
 		 708 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  23.69 
 
 		 692 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0794  Carbohydrate-selective porin OprB  26.32 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000421873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  26.61 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  33.88 
 
 		 670 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  25.09 
 
 		 703 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  40.43 
 
 		 622 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  21.95 
 
 		 674 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  25.82 
 
 		 703 aa  43.5  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  34.69 
 
 		 491 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>