91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2711 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2655  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2711  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0424  transcriptional regulator, Crp family  26.92 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4894  transcriptional regulator, Crp family  26.92 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770605  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0345  Crp family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.254354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0477  Crp family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0933534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0352  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0411  transcriptional regulator, Crp family  25.96 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000553573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  24.51 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.14 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.34 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.55 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.19 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.99 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.99 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.6 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  23.03 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.35 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  21.53 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  21.53 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.98 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  21.53 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  20.94 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.35 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.31 
 
 		 226 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  22.11 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.71 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.54 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.79 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  20 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  21.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  21.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  20.98 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  20.98 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.2 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  20 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  16.95 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  21.32 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  20.98 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.61 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.5 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  20.98 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 		 238 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0137  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.18 
 
 		 243 aa  42  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.13 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>