More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1237 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1237  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 547 aa  1083    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232329  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.666301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2277  ATP-binding region, ATPase-like  32.98 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3354  histidine kinase  28.35 
 
 		 555 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  30.7 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  28.11 
 
 		 954 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  29.78 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 351 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 351 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  31.13 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0781  putative signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.07 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.51 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  29.76 
 
 		 1009 aa  70.5  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.4 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  28.4 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  29.07 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  28.4 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.4 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.73 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.73 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  27.73 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.73 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.4 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.4 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.4 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.73 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.4 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.73 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  28.03 
 
 		 643 aa  68.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  30.61 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  26.14 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  28.65 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.51 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 397 aa  67  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  31.28 
 
 		 591 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  28.43 
 
 		 430 aa  67  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.02 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.43 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  26.34 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.6 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  31.36 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  27 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 1648 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  26.09 
 
 		 1033 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5070  putative signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  24.39 
 
 		 1048 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  26.56 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  29.09 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0603  signal transduction histidine kinase sensor  24.9 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0220625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1317  sensory box sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  29.76 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2369  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.1 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  30.32 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 742 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  26.2 
 
 		 693 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 775 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  24.69 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0853  putative signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000112347  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 605 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  31.48 
 
 		 622 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  28.36 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 665 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 1030 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>