More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2013 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 332 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.08 
 
 		 339 aa  488  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.99 
 
 		 331 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 335 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.42 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.42 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 337 aa  308  9e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 332 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 332 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 348 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 338 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 332 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 338 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 335 aa  298  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 336 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  44.72 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 337 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 337 aa  291  7e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 345 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  45.61 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 332 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 335 aa  288  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0110  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0167  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>