More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1634 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1634  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
266 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00873489  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.28663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4361  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.09 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1983  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 
259 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4074  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
260 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326701  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8759  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 
269 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24255  normal  0.0776287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 
271 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 
270 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 
270 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1984  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 
270 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.928303  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 
270 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1831  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
365 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
258 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
260 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
266 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
258 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
257 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
263 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.49 
 
 
258 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
258 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
257 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 
258 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 
258 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.04 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.49 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
260 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  31.14 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.76 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  30.87 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.63 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.49 
 
 
257 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  30.21 
 
 
295 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
257 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
257 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
256 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  34.04 
 
 
253 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
257 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  31.19 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.9 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.49 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  29.24 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.54 
 
 
265 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  31 
 
 
267 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
264 aa  92  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
261 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 
289 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.69 
 
 
269 aa  92  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.77 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.9 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  27.84 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.22 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.19 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>