76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1593 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  46.69 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  39.3 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  38.96 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  36.55 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  35.06 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  37.5 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  37.1 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  40.16 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  38 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  28.3 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  26.97 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  26.06 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  26.06 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 403 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  25.45 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  24.14 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  24.14 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.82 
 
 		 447 aa  58.9  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  21.71 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.49 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  26.47 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.95 
 
 		 450 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  26.54 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  23.27 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  22.31 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 		 415 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 713 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3244  diguanylate cyclase  20.78 
 
 		 454 aa  52.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5548  methyl-accepting chemotaxis protein  25.53 
 
 		 434 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5403  methyl-accepting chemotaxis protein  25.53 
 
 		 434 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00599432  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5103  methyl-accepting chemotaxis protein, C-terminal region  25.53 
 
 		 433 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.345506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5552  methyl-accepting chemotaxis protein  24.82 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000569717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5120  methyl-accepting chemotaxis protein, C-terminal region  25.53 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.88 
 
 		 505 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0566767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000498313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5519  methyl-accepting chemotaxis protein  24.82 
 
 		 433 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5276  methyl-accepting chemotaxis protein  25.36 
 
 		 433 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5673  methyl-accepting chemotaxis protein  25.36 
 
 		 433 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5604  methyl-accepting chemotaxis protein  24.82 
 
 		 398 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000610114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 507 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264745  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 		 531 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.483034  normal  0.19588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  22.39 
 
 		 472 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  27.66 
 
 		 504 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3071  hypothetical protein  22.29 
 
 		 173 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0262  chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 442 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2927  hypothetical protein  26.47 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00646124  hitchhiker  0.00430605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  26.4 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1679  diguanylate cyclase  25.22 
 
 		 460 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1683  diguanylate cyclase  25.22 
 
 		 460 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1575  diguanylate cyclase  25.22 
 
 		 460 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2103  diguanylate cyclase  25.22 
 
 		 460 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2167  diguanylate cyclase  26.09 
 
 		 460 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4450  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.21 
 
 		 765 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2157  diguanylate cyclase  25.22 
 
 		 460 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0941263  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.71 
 
 		 526 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.71 
 
 		 545 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.074609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.47 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.26 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.17 
 
 		 494 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  23.93 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1649  diguanylate cyclase  26.43 
 
 		 453 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.103879  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2619  diguanylate cyclase  23.08 
 
 		 471 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1194  diguanylate cyclase  19.13 
 
 		 471 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361877  normal  0.129887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>