38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5252 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  74.86 
 
 		 186 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  35.4 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  33.77 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  29.19 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  29.81 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  26.44 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  29.05 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  27.1 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  27.1 
 
 		 379 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 485 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 397 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 397 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  26.45 
 
 		 379 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  31.97 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  28.26 
 
 		 302 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.87 
 
 		 515 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 403 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  32.52 
 
 		 299 aa  51.6  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  29.79 
 
 		 377 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  32.22 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  26 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.79 
 
 		 526 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  39.74 
 
 		 299 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  26.4 
 
 		 260 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0022  hypothetical protein  61.76 
 
 		 62 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  31.68 
 
 		 300 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  24.07 
 
 		 387 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  24.07 
 
 		 387 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  24.07 
 
 		 387 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.56 
 
 		 450 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1847  diguanylate cyclase  32.86 
 
 		 470 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 472 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 481 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 		 447 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2619  diguanylate cyclase  31.43 
 
 		 471 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>