15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2927 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2927  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00646124  hitchhiker  0.00430605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1089  hypothetical protein  69.39 
 
 
196 aa  296  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.665947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3269  hypothetical protein  66.33 
 
 
196 aa  289  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310594  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2863  hypothetical protein  66.49 
 
 
194 aa  289  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1207  hypothetical protein  63.27 
 
 
196 aa  286  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469541  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2110  hypothetical protein  59.69 
 
 
196 aa  262  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0727  hypothetical protein  62.43 
 
 
197 aa  261  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0549  protogloblin ApPgb  55.79 
 
 
191 aa  222  3e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0446629  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1764  hypothetical protein  52.82 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17490  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563394  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  27.36 
 
 
387 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  27.36 
 
 
387 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  27.36 
 
 
387 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  28.09 
 
 
403 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>