16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2110 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0727  hypothetical protein  64.02 
 
 		 197 aa  277  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1089  hypothetical protein  60.71 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.665947  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2927  hypothetical protein  59.69 
 
 		 195 aa  262  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00646124  hitchhiker  0.00430605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1207  hypothetical protein  56.63 
 
 		 196 aa  254  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2863  hypothetical protein  58.12 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3269  hypothetical protein  56.12 
 
 		 196 aa  248  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1764  hypothetical protein  55.28 
 
 		 197 aa  220  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0549  protogloblin ApPgb  47.92 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0446629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17490  hypothetical protein  49.2 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  25 
 
 		 397 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  25 
 
 		 397 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  25.88 
 
 		 403 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  24.05 
 
 		 387 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  24.05 
 
 		 387 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  24.05 
 
 		 387 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>