46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1128 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  46.69 
 
 		 260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  39.59 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  37.28 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  33.79 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  36.45 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  37.46 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  37.15 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  34.45 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  36.99 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  26.54 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  26.54 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  25.31 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  25.9 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  28.76 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  24.69 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  27.92 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  25.56 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  29.08 
 
 		 183 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.91 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 387 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 387 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 387 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.33 
 
 		 498 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1847  diguanylate cyclase  22.09 
 
 		 470 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2619  diguanylate cyclase  22.09 
 
 		 471 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 		 578 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 		 507 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264745  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0506  hypothetical protein  28.18 
 
 		 152 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 481 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 545 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.074609 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  30.59 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.69 
 
 		 485 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.27 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  27.97 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  29.33 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.25 
 
 		 415 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1836  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  20 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3244  diguanylate cyclase  27.38 
 
 		 454 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.79 
 
 		 505 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0566767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>