44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1801 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  64.86 
 
 		 183 aa  237  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  56.52 
 
 		 196 aa  215  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  32.3 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  29.19 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  31.29 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 515 aa  64.7  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  31.34 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  25.56 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  32.48 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  30.6 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  30.6 
 
 		 379 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  32.48 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  33.91 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  29.93 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  22.7 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  25.36 
 
 		 397 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  25.36 
 
 		 397 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  25 
 
 		 403 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.28 
 
 		 526 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  29.67 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.48 
 
 		 445 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 387 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 387 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 387 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  25.48 
 
 		 382 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  32.74 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  27.41 
 
 		 308 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.79 
 
 		 447 aa  48.5  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  26.09 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  26.24 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  25.26 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 432 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457708  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1405  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.59 
 
 		 879 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5211  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.48 
 
 		 445 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  44.7  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 517 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.24 
 
 		 485 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 578 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 713 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0262  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 442 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 		 450 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.49 
 
 		 505 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0566767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>