48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3913 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  373  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  83.52 
 
 		 183 aa  315  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  55.31 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  34.1 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  32.35 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  32.35 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  32.35 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  32.45 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  30.56 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  28.47 
 
 		 300 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  29.38 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  28.32 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  31.72 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  24.14 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  29.93 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  24.6 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  27.45 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  27.78 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 485 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  27.78 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.3 
 
 		 531 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.483034  normal  0.19588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.36 
 
 		 510 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  26.09 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 432 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457708  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.6 
 
 		 498 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  25.34 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3244  diguanylate cyclase  28.97 
 
 		 454 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 387 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 387 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 387 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 415 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.28 
 
 		 432 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000498313  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 517 aa  44.7  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.63 
 
 		 494 aa  44.3  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  28.71 
 
 		 472 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 		 432 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  31.82 
 
 		 504 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00328784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5211  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.04 
 
 		 445 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  34.15 
 
 		 377 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  31.71 
 
 		 397 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  26.79 
 
 		 473 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  31.71 
 
 		 397 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.04 
 
 		 545 aa  40.8  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.074609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 403 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>