52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1329 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  72.15 
 
 		 300 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  74.83 
 
 		 299 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  75.25 
 
 		 299 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  69.83 
 
 		 300 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  65.55 
 
 		 299 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  56.46 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  37.28 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  31.88 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  38.96 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  31.55 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  31.36 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  31.36 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  30.77 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  37.76 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  30.56 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  32.77 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  29.08 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  24.48 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  24.48 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  28.3 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  29.05 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  27.43 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  27.43 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  27.43 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0506  hypothetical protein  31.97 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.03 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  29.63 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  23.78 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0484  hypothetical protein  26.24 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.875691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.14 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  27.94 
 
 		 183 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1836  hypothetical protein  31.67 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0844  hypothetical protein  31.43 
 
 		 172 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0384719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 507 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264745  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5211  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 445 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.54 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000498313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.36 
 
 		 510 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 		 485 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 447 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1314  hypothetical protein  28.21 
 
 		 80 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  26.67 
 
 		 504 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.47 
 
 		 494 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0762  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.6 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0230415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 578 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1405  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.12 
 
 		 879 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.66 
 
 		 449 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1244  diguanylate phosphodiesterase  29.07 
 
 		 800 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>