35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2403 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  74.86 
 
 
185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  34.44 
 
 
183 aa  99  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  32.3 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  29.38 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  29.08 
 
 
299 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  27.59 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  30.82 
 
 
382 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  26.55 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  28.1 
 
 
300 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 
526 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.85 
 
 
485 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  28.21 
 
 
379 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  28.21 
 
 
379 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  28.32 
 
 
302 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  27.63 
 
 
300 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  28.76 
 
 
299 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  27.78 
 
 
397 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  27.78 
 
 
397 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  27.56 
 
 
379 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  27.78 
 
 
403 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.68 
 
 
515 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0022  hypothetical protein  58.82 
 
 
62 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  27.17 
 
 
377 aa  48.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  28.16 
 
 
260 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
308 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  25.93 
 
 
387 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  25.93 
 
 
387 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  25.93 
 
 
387 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  26.21 
 
 
298 aa  44.7  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 
713 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140639  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
481 aa  41.2  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>