42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3232 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  83.52 
 
 		 182 aa  315  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  57.54 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  32.47 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  31.76 
 
 		 379 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  34 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  25.9 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  31.18 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  37.76 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  31.18 
 
 		 379 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  26.54 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  26.44 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  28.36 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  28.86 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  26.19 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  27.59 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  24.14 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  27.15 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  28.35 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.61 
 
 		 415 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3244  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 454 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.89 
 
 		 432 aa  48.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000498313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 		 531 aa  48.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.483034  normal  0.19588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 515 aa  47.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  25.26 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  29.03 
 
 		 298 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 473 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 		 485 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 498 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.16 
 
 		 251 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 		 432 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  29.41 
 
 		 504 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.36 
 
 		 510 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.27 
 
 		 505 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0566767  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  28.43 
 
 		 377 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5103  methyl-accepting chemotaxis protein, C-terminal region  25 
 
 		 433 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.345506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5673  methyl-accepting chemotaxis protein  24.07 
 
 		 433 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5120  methyl-accepting chemotaxis protein, C-terminal region  24.07 
 
 		 433 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5276  methyl-accepting chemotaxis protein  24.07 
 
 		 433 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085995  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.76 
 
 		 545 aa  41.2  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.074609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 481 aa  41.2  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>