30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0458 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  100 
 
 		 353 aa  706    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1988  nitrite reductase NirF  51.18 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0342  cytochrome d1 heme region  34.29 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00493311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  29.92 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  29.92 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  28.69 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  29.23 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  27.45 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  25.86 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  24.93 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  27.22 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  24.87 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  24.36 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  24.36 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  24.65 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  25 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  23.35 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  25.88 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  28.89 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  23.58 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  23.4 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  24.76 
 
 		 504 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  24.51 
 
 		 528 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  21.16 
 
 		 542 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  21.16 
 
 		 566 aa  50.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  23.43 
 
 		 519 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  25.64 
 
 		 542 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  22.15 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  21.55 
 
 		 525 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1259  hypothetical protein  28.33 
 
 		 453 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>