27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1988 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1988  nitrite reductase NirF  100 
 
 		 378 aa  758    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  51.18 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0342  cytochrome d1 heme region  35.87 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00493311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  29.72 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  29.38 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  26.74 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  26.04 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  26.04 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.61 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.34 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  26.01 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  25.9 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  24.73 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  26.24 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  25.34 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  25.19 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  25.87 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  26.25 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  25.23 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  24.14 
 
 		 527 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  25 
 
 		 547 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  24.4 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1259  hypothetical protein  29.35 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  24.07 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  26.15 
 
 		 556 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  23.34 
 
 		 517 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  30.09 
 
 		 528 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>