67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1905 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  65.4 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  64.53 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  62.56 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  62.09 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  63.21 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  63.21 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  268  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  57.62 
 
 		 217 aa  267  7e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  58.77 
 
 		 213 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  55.19 
 
 		 212 aa  247  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  55.19 
 
 		 212 aa  247  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  55.19 
 
 		 212 aa  247  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  55.19 
 
 		 212 aa  247  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  54.25 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  54.25 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  52.83 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  50.94 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  49.14 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  34.09 
 
 		 139 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.19 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  30.97 
 
 		 148 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  32.74 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.7 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.24 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.82 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  30.85 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  32.29 
 
 		 149 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  37.11 
 
 		 143 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  37.11 
 
 		 143 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  25.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.82 
 
 		 149 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.36 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  28.32 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  31.25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.12 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  31.25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  31.25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  25.66 
 
 		 150 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 		 370 aa  45.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  32 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  32 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  33.72 
 
 		 152 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.25 
 
 		 151 aa  45.1  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  35.14 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0352  ribose 5-phosphate isomerase B  26.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D05  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  24.07 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.305214  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  30.36 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  31.52 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  28.95 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  25.66 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2026  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  21.89 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359244  normal  0.295669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  27.19 
 
 		 149 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  26.02 
 
 		 153 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3456  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.2 
 
 		 171 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.12 
 
 		 151 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.61 
 
 		 148 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.25 
 
 		 147 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  28.32 
 
 		 148 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2093  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.76 
 
 		 171 aa  42  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  28.28 
 
 		 153 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>