38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2387 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  78.67 
 
 		 211 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  65.4 
 
 		 212 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  64.93 
 
 		 212 aa  304  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  61.97 
 
 		 217 aa  293  9e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  64.53 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  65.88 
 
 		 212 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  65.4 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  63.05 
 
 		 212 aa  285  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  61.14 
 
 		 213 aa  261  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  54.03 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  53.77 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  53.77 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  53.77 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  54.46 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  54.25 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  52.11 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  52.11 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  52.11 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  51.89 
 
 		 212 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  52.61 
 
 		 212 aa  228  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  51.64 
 
 		 212 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  48.84 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  39.81 
 
 		 139 aa  92  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  30.58 
 
 		 149 aa  51.6  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.33 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  29.2 
 
 		 145 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.02 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  27.43 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  28.07 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  35.14 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  26.83 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.97 
 
 		 148 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  26.6 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  31.25 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000313562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0352  ribose 5-phosphate isomerase B  28.32 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  29.79 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>