30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000920 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  76.78 
 
 		 211 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  72.04 
 
 		 212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  72.04 
 
 		 212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  72.04 
 
 		 212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  72.04 
 
 		 212 aa  317  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  71.09 
 
 		 212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  71.09 
 
 		 212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  71.09 
 
 		 212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  70.62 
 
 		 212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  70.62 
 
 		 212 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  67.77 
 
 		 212 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  67.24 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  52.83 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  54.5 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  54.03 
 
 		 213 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  54.5 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  53.55 
 
 		 212 aa  234  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  51.9 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  51.9 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  55.66 
 
 		 212 aa  227  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  224  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  53.55 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  33.98 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  30.58 
 
 		 149 aa  48.1  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.83 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.25 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  28.26 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  33.33 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000313562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>