56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3514 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  85.85 
 
 		 217 aa  380  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  78.57 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  63.33 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  63.05 
 
 		 213 aa  285  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  59.52 
 
 		 212 aa  277  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  59.52 
 
 		 212 aa  276  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  268  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  59.52 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  58.1 
 
 		 212 aa  254  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  54.98 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  51.9 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  49.76 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  50.7 
 
 		 212 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  48.34 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  48.34 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  48.34 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  47.39 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  47.39 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  47.39 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  47.39 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  46.92 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  47.13 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  33.33 
 
 		 139 aa  91.7  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  32.74 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  33.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.74 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1794  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  34.86 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.623849  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.85 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 		 370 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.63 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 150 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  31.3 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.71 
 
 		 143 aa  45.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2093  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.33 
 
 		 171 aa  45.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D05  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  34 
 
 		 171 aa  45.1  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.305214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.95 
 
 		 149 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.2 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2225  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  35 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  30.97 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  26.62 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.93 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.73 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2264  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  35 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0070  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  31.86 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000149222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.09 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3456  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.88 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.2 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0352  ribose 5-phosphate isomerase B  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  29.46 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  31.58 
 
 		 149 aa  42.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.96 
 
 		 149 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  28.12 
 
 		 148 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  28 
 
 		 149 aa  42  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1930  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  35.16 
 
 		 171 aa  41.6  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00064088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>