50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1562 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  91.94 
 
 		 212 aa  400  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  91 
 
 		 212 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  96.23 
 
 		 212 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  72.99 
 
 		 211 aa  329  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  65.88 
 
 		 213 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  63.21 
 
 		 212 aa  295  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  60.48 
 
 		 217 aa  281  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  59.52 
 
 		 212 aa  273  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  59.72 
 
 		 213 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  55.66 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  54.72 
 
 		 212 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  54.25 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  53.77 
 
 		 212 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  53.77 
 
 		 212 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  53.77 
 
 		 212 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  52.36 
 
 		 212 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  53.77 
 
 		 211 aa  227  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  52.36 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  50.29 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  35.61 
 
 		 139 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  29.93 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.43 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.79 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 370 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.99 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  30.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1794  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  35.87 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.623849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.09 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  29.25 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.11 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  26.87 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.99 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  25.66 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  28.76 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D05  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  26.49 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.305214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.48 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  29.79 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  30.34 
 
 		 145 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  30.07 
 
 		 149 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  30.07 
 
 		 149 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.37 
 
 		 147 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3169  Ribose/galactose isomerase  28.32 
 
 		 151 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.31 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>