30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2490 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  90.05 
 
 		 212 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  88.63 
 
 		 212 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  88.15 
 
 		 212 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  87.74 
 
 		 212 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  88.63 
 
 		 212 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  88.63 
 
 		 212 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  76.78 
 
 		 211 aa  349  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  73.93 
 
 		 212 aa  327  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  72.04 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  73.14 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  55.19 
 
 		 212 aa  247  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  55.19 
 
 		 211 aa  241  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  53.77 
 
 		 213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  53.52 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  52.58 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  51.17 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  48.34 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  53.77 
 
 		 212 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  53.3 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  49.77 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  28.57 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.4 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.4 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.09 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  29.77 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.9 
 
 		 140 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  38.03 
 
 		 145 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>